Molecular Structure |
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Mnova允许用户导入分子结构并与之交互。
目前，分子结构可以作为.mol、.cdx、cdxml、.mrv 或 .sdf 文件导入 ，只需使用 "Open（打开）"命令（或将文件拖放到 Mnova 图标或界面上）即可，与应用于波谱的方式完全相同。拖放 "操作目前仅限于ACD ChemSketch、Marvin 和 ChemDraw。
您还可以导入 cdxml 格式的反应：
如果您安装了 OpenBabel，还可以加载（或复制粘贴） INCHI 和 SMILE 格式的分子结构。例如，您可以将上面的每一行（SMILE 和 INCHI 格式的分子）复制到剪贴板，然后运行 Mnova 并将其粘贴为分子结构： COc1cc(ccc1)C#N InChI=1S/C9H7F3O2/c10-6-2-1-5(7(11)8(6)12)9-13-3-4-14-9/h1-2,9H,3-4H2
您也可以将结构复制为 MDL SK 格式（带缩写基团），只需将分子结构复制到剪贴板（例如从 ChemDraw），然后按照菜单 "编辑/粘贴特殊 "操作即可：
您可以通过上述对话框中的 "ChemDraw Exchage file "保留 ChemDraw 中的编号或缩写结构。
如果您使用的是 IsisDraw，请注意需要在 "选项/常规设置 "菜单中选择将分子复制为 mol 文件。
分子结构的处理（调整大小、移动、对齐、复制、粘贴等）与所有其他 Mnova 对象完全相同。分子结构可以导入到一个单独的页面，也可以导入到已被其他对象占用的页面，例如其 适用的波谱。
在与分子结构交互时，您首先会发现当鼠标悬停在原子上时，原子会在红色透明框中突出 显示。如下图所示，点击特定原子将使其成为活动原子，并在红色框内高亮显示，背景为粉色。在与分子进行交互时，原子选择将变得非常重要，下文将对此进行介绍。
Mnova允许您使用对象 "属性 "对话框自定义分子的外观。双击分子或右击并向下滚动到 "属性 "对话框，即可进入该对话框。
通过 "Properties（属性）"对话框，您可以自定义分子的大小、分子与纸张的角度（几何 属性）以及所有表示属性，例如是否显示明确的碳原子和氢原子、是否显示原子序数、键的 长度和间距等。因此，如下图所示，同一分子可以有多种不同的表示方法。
要自定义分子中所有原子标签的外观，只需双击此按钮
在下面的示例中，原子标签包含了 "原子编号 "和 "预测化学位移 "的信息：
双击相应原子可编辑其标签：
您可以为原子标签添加宏（如上几行所示）以包含 "注释"、"原子序数"、"赋值"（化学位移 列表、范围或平均值）、"预测化学位移 "等信息。
当同一原子有多个赋值时，可以使用 "Multiple Display（多重显示）"参数将赋值显示为列表 （未添加值时）、范围（设置 rng 时）或平均值（设置 avg 时）。
输入 $ 前缀可为数字添加希腊字母；例如，$a, 4$b, 22$g$d21 将转换为 α, 4β, 22γδ21：
要定义同位素，只需在 "同位素 "字段中输入质量数。例如，如果是 C 原子，您可以输入 12、13 和 14。可以通过输入 0 或删除字段中的数字来删除原子的同位素编号（和电荷量）。
您可以输入任何注释，如注释或不同的编号（只需更改 "编号 "单元格的值）。您可以更改原子或高亮显示的颜色，甚至只需点击该按钮即可添加任何属性。
在本示例中，我们更改了原子 25 的编号（新编号为 99），并添加了一个宏以显示 "原子编号"、"注释"（测试）和 "自定义属性"（Vinyl），同时将颜色改为绿色并突出显示黄色：
选中一个原子并输入所需的编号以重新编号。如果新编号已经存在，重复的编号上将显示 # 符号。
新编号可以导出为 mol 文件，您也可以在 文件/首选项/分子 菜单中选择相应选项 "导入分子样式" （用于 "编辑/粘贴特殊 "功能） 。
键盘编辑始终可用 "首选项允许您将鼠标悬停在原子上时输入任意字母。
右键点击分子结构中的任意原子编号将显示一个上下文菜单，您可以通过该菜单将赋值、 预测、编号、注释或立体描述符显示为原子标签：
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